বিচারকদের নিয়োগকারী সুপ্রিম কোর্টের প্রতিষ্ঠান কোলেজিয়ামের সিদ্ধান্ত নিয়ে বিতর্ক উঠেছে। ২০১৮ সালের ১২ জানুয়ারি সুপ্রিম কোর্টের বিচারপতি রঞ্জন গগৈ এবং তিনজন বিচারকসাংবাদিক সম্মেলনে বলেন যে, সুপ্রিম কোর্টে স্বচ্ছতা থাকতে হবে। সেই সময় সন্দেহের সূচিতে প্রধান বিচারপতি দীপক মিশ্রর নাম উঠে আসে। যখন রঞ্জন গগৈ প্রধান বিচারপতি হন তখন তাদের নেতৃত্বে ১০ জানুয়ারি কোলেজিয়ামের সভায় গৃহীত সিদ্ধান্তের ভিত্তিতে প্রশ্ন উত্থাপিত হয়। অবসরপ্রাপ্ত প্রধানবিচারপতি আর এম লোডা বলেন যে সিদ্ধান্ত কী কারণে পরিবর্তিত হয়েছে, তা জনসাধারণকে জানাতে হবে। দিল্লি হাই কোর্টের অবসরপ্রাপ্ত বিচারপতি কৈলাশ গম্ভীর রাষ্ট্রপতিকে চিঠি লিখে জানান যে কোলেজিয়ামের সিদ্ধান্তে তিনি যাতে স্বাক্ষর না করেন। বিচারপতি খান্নাকে সুপ্রিম কোর্টে প্রমোট হতে বাধা দিন কারণ তাঁকে নিজেদের থেকে ৩২ জন সিনিয়র বিচারপতিকে লঙ্ঘন করে সুপ্রিম কোর্টে প্রমোট করা হচ্ছে। এর মাধ্যমে বিচারব্যবস্থায় সমস্যা বৃদ্ধি পাবে।